税務調査が「時間の短い会社」と「時間の長い会社」の違い

~調査官が重視する事前準備とは?~

税務調査は企業ごとに「長さ」が異なります。半日で終わる会社もあれば、3日以上かかる会社もあります。

その違いは何か?

結論から言えば、「事前準備で決まる」ということです。

法人の税務調査は通常2~3日程度かかりますが、税理士が関与して事前に修正申告を行っている場合、半日で終わるケースも少なくありません。

本記事では、税務調査が早く終わる企業の特徴と、企業がやるべき事前準備を実務的な視点から解説します。


調査が早く終わる企業の特徴①:資料がすぐに出てくる

調査官が最も嫌うのは「確認したい資料が見つからない」状況です。

資料がすぐ出てこない企業は、その時点で調査官が疑念を抱き、調査が深掘りされます。

【実例】ある製造業GGG社のケース

GGG社は税務調査で外注費の確認を求められました。しかし、契約書を探すのに30分以上かかり、成果物のフォルダも見つからず、結局「後日提出します」と回答。

調査官は「資料管理が不十分」と判断し、他の科目も徹底的にチェック。通常2日で終わる調査が5日に延長され、最終的に約200万円の追徴課税となりました。

対策

  • 月別・案件別に資料を整理
  • フォルダ構成を統一
  • 調査前に資料の所在確認
  • チェックリストの作成

調査が早く終わる企業の特徴②:経理担当者の説明が明確

説明が曖昧だったり、担当者と経営者で回答が食い違う企業は、調査が長引きます。

逆に、回答が明確で一貫している企業は、調査官が安心します。

【実例】あるIT企業HHH社のケース

HHH社の税務調査で、調査官が「売上計上の基準は?」と質問したところ、経理担当者は「検収日です」と即答し、社内規程を提示しました。社長も同じ回答をし、説明が一致していました。

調査官は「管理がしっかりしている」と判断し、通常2日の調査を1日半で終了。指摘事項もゼロでした。

対策

想定問答集の作成

  • Q:売上はいつ計上していますか?
  • Q:交際費と会議費の区分基準は?
  • Q:役員貸付金の発生理由は?
  • Q:外注費の成果物はありますか?

経理担当者と経営者で回答を事前にすり合わせておきましょう。


調査が早く終わる企業の特徴③:売上計上基準が明確

売上計上のミスは、調査官にとって最大の論点です。

基準が曖昧な企業→深掘り 基準が明確な企業→短時間で終了

売上計上は、事前に資料化しておくべきです。

【実例】ある建設業III社のケース

III社は税務調査前に「売上計上基準書」を作成していました。

  • 商品販売:納品日で計上
  • 工事契約:検収書受領日で計上
  • 保守契約:役務提供期間に按分して計上

調査官にこの資料を提示したところ、「明確で問題ない」と判断され、売上関連の確認はわずか30分で終了しました。

対策

売上計上基準書の作成例:

【売上計上基準】
1. 商品販売:納品日
2. 工事契約:検収日
3. サービス提供:役務提供完了日
4. サブスク契約:提供期間に按分

【適用開始日】2026年1月1日

調査が早く終わる企業の特徴④:役員勘定が少ない

調査官は役員勘定が大好き(=最も疑う)です。ここが薄ければ薄いほど、調査はスムーズです。

役員貸付金は、決算書にあるだけでマイナス評価になり、理想的な残高は0円です。

【実例】ある小売業JJJ社のケース

JJJ社は役員貸付金が500万円ありました。調査官が「これは何ですか?」と質問したところ、社長は「いつの間にか増えていて…理由はよくわかりません」と曖昧に回答。

調査官は「管理が甘い」と判断し、過去3年分の役員関連の支出を全てチェック。私的支出が複数見つかり、約150万円の追徴課税となりました。

対策

  • 役員貸付金は年内にゼロにする
  • 金銭消費貸借契約書の作成
  • 適正な利率(年0.9%以上)での利息計上
  • 明確な返済スケジュールの設定

調査が早く終わる企業の特徴⑤:外注費・広告費の成果物が揃っている

調査官が必ず深掘りする科目です。ここが綺麗に揃っている企業は、調査官の印象が非常に良くなります。

【実例】あるWeb制作会社KKK社のケース

KKK社は外注費の管理を徹底していました。

フォルダ構成:

/2026年/外注費/
  ├案件A/
  │  ├契約書.pdf
  │  ├請求書.pdf
  │  ├成果物/
  │  └支払エビデンス.pdf

調査官が「外注費を確認させてください」と言うと、すぐにフォルダを提示。契約書・成果物・請求書・支払記録が全て揃っており、調査官は「完璧ですね」と納得。外注費の確認はわずか20分で終了しました。

対策

4点セットの整備

  1. 契約書(期間、内容、金額、成果物の範囲)
  2. 請求書(契約内容との整合性)
  3. 成果物(納品データ、作業報告書、提出物)
  4. 支払実績(銀行口座からの支払記録)

企業がやるべき事前準備①:証憑フォルダの整理

調査官がストレスなく資料を確認できる状態を作りましょう。

整理すべき証憑

  • 領収書
  • 請求書
  • 成果物
  • 契約書
  • 支払記録

これらを案件別・月別で整理すること。


企業がやるべき事前準備②:売上計上の説明資料

売上の流れを図解化しておく企業は強いです。

フローチャート例

受注 → 納品 → 検収書受領 → 売上計上 → 請求書発行 → 入金

このような図を1枚作っておくだけで、調査官の理解が早まります。


企業がやるべき事前準備③:役員勘定の月次リセット

調査官がもっとも突くポイントを、事前に削っておきましょう。

1月のタイミングで実施

  • 役員貸付金の残高確認
  • 返済計画の作成
  • 理想は1月中にゼロにすること

企業がやるべき事前準備④:想定問答集の作成

調査官が必ず聞く質問に対して、明確に答えられるように準備しましょう。

想定問答の例

質問回答例
売上はいつ計上していますか?検収日で統一しています。社内規程があります。
交際費と会議費の区分は?1人あたり5,000円以下は会議費、超える場合は交際費です。
役員貸付金はありますか?現在ゼロです。発生時は即座に返済しています。
外注費の成果物はありますか?はい、全てフォルダに整理されています。

企業がやるべき事前準備⑤:税理士との事前ミーティング

調査前に税理士と以下を確認しましょう。

確認事項

  • 想定される論点
  • 過去の処理で気になる点
  • 資料の準備状況
  • 当日の役割分担

税理士が関与していると、調査がスムーズに進み、早期に終了するケースが多い傾向にあります。


税務調査の事前準備に不安がある経営者の方へ

「調査前に何を準備すればいいかわからない…」 「資料がバラバラで、すぐに出せるか不安…」 「調査官の質問に適切に答えられるか心配…」

そんな経営者の方におすすめなのが、CROSSROAD税理士事務所の「税務調査あんしん対策パック」です。

サービスの内容

このサービスは、企業の税務状況を徹底調査・改善し、今後に向けての対策を3か月かけて実施するものです。

具体的な内容

  • 現状の資料整理状況の確認
  • 証憑フォルダの整理支援
  • 売上計上基準の文書化支援
  • 想定問答集の作成サポート
  • 税務調査対応のシミュレーション
  • 調査当日の立ち会い

企業が税務調査の対象となる確率は約4%ですが、事前準備をしっかり行っている企業ほど、調査は短時間でスムーズに終了します。

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まとめ:税務調査は”準備した企業が勝つ”

1月は調査対策に最適な月です。社内整備を進め、調査官に「整っている企業」と評価されれば、調査は早く終わります。

調査が早く終わる企業の5つの特徴

  1. 資料がすぐに出てくる
  2. 経理担当者の説明が明確
  3. 売上計上基準が明確
  4. 役員勘定が少ない
  5. 外注費・広告費の成果物が揃っている

企業がやるべき5つの事前準備

  1. 証憑フォルダの整理
  2. 売上計上の説明資料作成
  3. 役員勘定の月次リセット
  4. 想定問答集の作成
  5. 税理士との事前ミーティング

【今日からできるアクション】

  1. 証憑フォルダを月別・案件別に整理する
  2. 売上計上基準を文書化する
  3. 役員貸付金の残高を確認し、返済計画を立てる
  4. 想定問答集を作成し、経理担当者と共有する
  5. 税務調査あんしん対策パックで専門家のサポートを受ける

これらを実践することで、あなたの会社は確実に「税務調査に強い企業」になります。